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田越、大原さんあたりの誰かに柏のkagra main systemの利用アカウントが欲しい旨を連絡する。

== startup ==
主にアカウント発行の際にメールでもらえるguideに沿って行えば良い

一応、[[https://gwdoc.icrr.u-tokyo.ac.jp/cgi-bin/private/DocDB/ShowDocument?docid=10076|JGW doc]]にも資料がある
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pipを用いてライブラリをinstallする
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面倒くさいので~/.bashrcなどに 今後、仮想環境を有効にする際は毎回これを打つ必要があり、面倒くさいので~/.bashrcに
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alias nenv='source ~/.virtualenvs/new_env/bin/activate' alias nenv=source ~/.virtualenvs/new_env/bin/activate
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と書けば、nenvと打つだけで仮想環境を有効にできる
もしくは、~/.bash_profileや~/.bashrcに
{{{
if [[ $- =~ i ]]; then
        source ~/.virtualenvs/new_env/bin/activate
fi
}}}
と書くと、ログイン時に毎回仮想環境が立ち上がってくれる
次に仮想環境を有効にした状態でpipを用いてlibraryをinstallする
{{{
pip install -U pip
pip install gwpy lalsuite
}}}
lalsuiteもinstallしないとframe fileが読めないので注意
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gwpyをinstallする時に必要なものはほとんど一緒にinstallされると思うが、他に必要なlibraryがある場合は別途pip installを用いてinstallする
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自身のpc上のeditorを愛している方や、ネットワークが弱くsshでm31-01にログインした状態で作業するのにストレスがある方向け

柏PCの使い方

Contents

  1. 目的
  2. セットアップ
    1. アカウント申請
    2. startup
    3. frame fileを読んでみる(python)
  3. kashiwa PCのdefault環境では満足できない方へ
    1. virtualenv
  4. 自身のPC上でprogram編集と結果閲覧を完結したい人向け
  5. 詰まった問題

目的

kashiwa PCを使用してframe fileをみんなが快適に解析できるようにできるようにしたい

あと環境構築などで詰まったことの備忘録

セットアップ

アカウント申請

田越、大原さんあたりの誰かに柏のkagra main systemの利用アカウントが欲しい旨を連絡する。

startup

主にアカウント発行の際にメールでもらえるguideに沿って行えば良い

一応、JGW docにも資料がある

frame fileを読んでみる(python)

環境はほとんどできているはずなのでgwpyを使ってframe fileを読んでみる Lecture in Japanese

frame fileを読んで様々なplotを書くためのsample codeやcondor_jobを使ってjobを投げるためのshellなどが豊富にある Kozapy

kashiwa PCのdefault環境では満足できない方へ

virtualenv

matplotlibが古すぎてplotがダサくなる方やgwpyのerrorが自身のPCと異なり困る方など向け

おそらくkashiwaでpython環境構築に使うのが推奨されているのがvirtualenvである 

ssh m31-01

などでkashiwa PCにログイン 仮想環境の構築（python3.7の部分は好みのversionで良い, 後ろの~/.vir~の部分も好きなpathに好きな名前で置いても良い） 

virtualenv -p python3.7 ~/.virtualenvs/new_env

仮想環境を有効にする 

source ~/.virtualenvs/new_env/bin/activate

今後、仮想環境を有効にする際は毎回これを打つ必要があり、面倒くさいので~/.bashrcに 

alias nenv=source ~/.virtualenvs/new_env/bin/activate

と書けば、nenvと打つだけで仮想環境を有効にできる もしくは、~/.bash_profileや~/.bashrcに 

if [[ $- =~ i ]]; then
        source ~/.virtualenvs/new_env/bin/activate
fi

と書くと、ログイン時に毎回仮想環境が立ち上がってくれる 次に仮想環境を有効にした状態でpipを用いてlibraryをinstallする 

pip install -U pip
pip install gwpy lalsuite

lalsuiteもinstallしないとframe fileが読めないので注意

gwpyをinstallする時に必要なものはほとんど一緒にinstallされると思うが、他に必要なlibraryがある場合は別途pip installを用いてinstallする

自身のPC上でprogram編集と結果閲覧を完結したい人向け

自身のpc上のeditorを愛している方や、ネットワークが弱くsshでm31-01にログインした状態で作業するのにストレスがある方向け

詰まった問題

KAGRA/Subgroups/PEM/UseKashiwaPC (last edited 2023-01-12 11:07:29 by tatsuki.washimi)