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Line 9: Line 9:
{{{#!wiki caution
'''注意'''

python初心者が書いています。「とりあえずこう書くとコレができる」というメモの集まりなので、(動作確認はしているけど)間違っていたり、より効率的な書き方があるでしょう。
}}}
Line 16: Line 11:
== 1. Pythonを使う準備 ==
 * 環境構築とかナシでとりあえずgwpyを使いたい場合
   * [[KAGRA/Subgroups/PEM/Portable/GWpy_Chromebook|Google Colaboratoryを使う]]
 * KAGRAメインサーバーを使う場合 (当然、KAGRAコラボレーター限定)
   * アカウント申請: [[https://gwdoc.icrr.u-tokyo.ac.jp/cgi-bin/private/DocDB/ShowDocument?docid=10201|JGW-M191020]]
   * スタートアップガイド: [[https://gwdoc.icrr.u-tokyo.ac.jp/cgi-bin/private/DocDB/ShowDocument?docid=10076|JGW-M1910076]]
   * DMGマニュアル: [[https://dac.icrr.u-tokyo.ac.jp/KAGRA/DAWG/DMG/Manuals]] <- DAC wikiへ入る方法: [[https://gwdoc.icrr.u-tokyo.ac.jp/cgi-bin/private/DocDB/ShowDocument?docid=11668|JGW-L2011668]]
   * 各データがどこにあるのか： [[https://gwdoc.icrr.u-tokyo.ac.jp/cgi-bin/private/DocDB/ShowDocument?docid=11083|JGW-G1911083]]
   * [[KAGRA/Subgroups/PEM/UseKashiwaPC|KAGRAメインサーバーの使い方]]
 * 自分や研究室のPCを使う場合
   * Windwsの場合、WSLでlinux (Ubuntsu/Debian)を入れる
   * [[KAGRA/Subgroups/PEM/Conda|Condaのインストール]]
 * 共通事項
   * [[KAGRA/Subgroups/PEM/PythonMemoJP/Library|ライブラリ(モジュール、パッケージ)のインストール]]
   * [[KAGRA/Subgroups/PEM/PythonMemoJP/Jupyter|Jupyter]] (Notebook, Lab)の導入

== 2. GWpyで遊ぼう ==
Line 17: Line 29:
 * [[KAGRA/Subgroups/PEM/UseKashiwaPC|KAGRAメインサーバーの使い方]]
Line 22: Line 31:

== X. その他 ==
Line 25: Line 36:
 * [[KAGRA/Subgroups/PEM/Portable/GWpy_Chromebook|Google Colaboratoryを使う]]
Line 27: Line 37:
---- == Y. HTCondorでジョブを投げる ==
Line 29: Line 39:
== よく使うモジュールリスト ==

 * ファイル操作など
    * glob
    * os


 * 数値計算関係
    * numpy : 基本はコレ
    * scipy
    * datetime ; 時刻を扱う
    * iminuit : Fitするときに使う ([[https://hackmd.io/@tenoto/Skl_wArqD|参考]])
    * probfit : Fitするときに使う
    * lmfit : Fitするときに使う
    * bottleneck
    * pandas : 表計算をしたり、csvファイルを読み書きしたり


 * 描画関係
   * matplotlib : 基本はコレ
   * plotly : ブラウザ上で拡大縮小などがインタラクティブにできる
   * PyQt5 : matplotlibよりも高速で、リアルタイム描画に向いているらしい

 * 機械学習
   * tensorflow
   * scikit-learn

 * 重力波関係
   * GWpy : 基本はコレ
   * lalsuite : フレームファイルの読み書きに必要。直接使わなくてもインストール必須
   * pycbc : CBC解析 (Matched filtering とか)
   * GWDetChar : DetChar解析
   * GWSumm : サマリーページ
   * GWDataFind : 重力波データを引っ張ってくる
   * pyomicron : オミクロントリガーを使う
   * dttxml : diagguiのxmlファイルを読み込む
   * nds2utils
   * python-nds2-client

 * 天文関係
   * astropy

 * 地球物理系
   * geopandas : 位置情報入りの表計算や地図のplotなど
   * pyprj : 地球上の距離計算
   * obspy : 地震波解析

 * オーディオ関係
   * pysoundfile
   * playsound
   * python-sounddevice
   * wavio		  * [[https://htcondor.org/index.html|公式]]
 * [[https://gwdoc.icrr.u-tokyo.ac.jp/cgi-bin/private/DocDB/ShowDocument?docid=11049|Tutorial on HTCondor (澤田さん)]]
 * [[https://gwdoc.icrr.u-tokyo.ac.jp/cgi-bin/private/DocDB/ShowDocument?docid=11162|Change in Configuration of HTCondor on KAGRA Main Data Server (大原さん)]]

Python memo in Japanese

世の中に便利なパッケージがたくさんあるのがpythonの強みでもあるが、調べ物をする際にあちこち回ることになるというデメリットにもなっている。
また、GWpy本家のexamplesは検索性がよくなく、答えを知らないと必要な情報になかなかたどり着けない。
日本語で書かれた資料もほとんどないので、とっつきにくい。

そこでこのwikiページでは、やりたいことベースで大まかに分類し、pythonを使ったframe fileデータ解析でよく使う情報を日本語でメモしていく。

1. Pythonを使う準備

2. GWpyで遊ぼう

X. その他

Y. HTCondorでジョブを投げる

KAGRA/Subgroups/PEM/PythonMemoJP (last edited 2023-11-14 09:34:12 by tatsuki.washimi)